Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1012224	1012491	268	34 [0]	[0] 96	[uup]–[pqiA]	[uup],[pqiA]

GGATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGGCTGC  >  W3110S.gb/1012161‑1012223                                                               | ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGCCGCAAAATGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:1199225/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:427403/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:993404/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:444310/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:503286/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:537357/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:557075/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:559225/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:607238/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:624552/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:642398/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:675512/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:84031/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:888456/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:890208/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:904047/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:918742/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:1154503/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:376463/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:326254/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:279933/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:255220/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:1849483/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:1819545/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:1797028/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:1653828/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:1613193/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:137946/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:1373402/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:1320516/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:1315136/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:130734/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:1259615/1‑63 (MQ=255) ggATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGgctgc  >  1:1201305/1‑63 (MQ=255)                                                               | GGATGCTTCCTTCTTCAGTCAGCCGCATGAGCAGACGCAAAAAGTGCTTGCTGATATGGCTGC  >  W3110S.gb/1012161‑1012223

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑