Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1048393	1048485	93	80 [0]	[0] 110	ymcB	conserved hypothetical protein

CAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTAAAA  >  W3110S.gb/1048328‑1048392                                                                 | cAATGGCCAGGCAGCTTAAAGGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:346938/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:260466/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:526341/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:482741/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:411422/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:400182/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:39308/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:352832/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:316866/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:271014/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:542905/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:257080/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:221017/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:220928/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1857569/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1831998/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1830938/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1768877/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1759581/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1009904/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:727650/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:977737/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:931004/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:862911/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:856773/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:811157/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:80667/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:806398/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:754764/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:744580/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1753547/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:710862/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:708931/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:688871/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:687231/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:659348/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:63926/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:581806/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:573737/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:568386/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1223465/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1392869/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:138543/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1366184/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1350114/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1333857/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1299402/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1291626/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1266127/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1247204/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1407263/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:117978/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1101055/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1082048/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1078778/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1066447/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:106400/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:105911/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1046296/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1017852/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1597076/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1734165/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1692409/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1671377/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1652960/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1640450/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1638680/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1636992/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:161745/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:158308/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1555496/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1538513/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1509639/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1501043/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1439286/65‑1 (MQ=255) cAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1417602/65‑1 (MQ=255) cAATGGACAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:16992/65‑1 (MQ=255)  aaTGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1741785/64‑1 (MQ=255)  aaTGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:1485699/64‑1 (MQ=255)  aaTGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTaaaa  <  1:440616/64‑1 (MQ=255)                                                                 | CAATGGCCAGGCAGCTTAAAAGATAAGAATTCTTCTTCATCAGTCAGGAACACGTTGCGTTAAAA  >  W3110S.gb/1048328‑1048392

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑