Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1051341	1051418	78	86 [0]	[0] 151	[cspH]	[cspH]

CTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTC  >  W3110S.gb/1051276‑1051340                                                                 | cTTAAATGGTTTAGTTTCTTTGTGGAGAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:855551/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTTGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:147415/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:251290/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:477421/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:396666/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:38529/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:380692/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:337449/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:32037/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:28289/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:262155/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:261841/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:519035/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:23531/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1877114/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1858364/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1846805/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:183720/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1835630/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1802089/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1093332/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1769797/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:706602/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:880997/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:856707/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:855821/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:854781/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:823570/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:813400/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:792375/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:783874/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:748148/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1801001/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:706489/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:67505/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:673169/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:654202/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:647970/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:633421/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:587268/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:576496/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:565776/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1304099/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1731575/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:143852/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1416979/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1397067/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1385413/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1374495/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1365569/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1359469/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1350816/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1310951/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1455275/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1281504/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1278640/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1261159/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:126038/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:12162/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1191625/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1171965/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1168372/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1126939/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1100830/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1577447/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1699831/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1698779/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1693652/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1665481/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1665039/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1636918/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1628755/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1623162/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:160385/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1587697/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1490986/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1576815/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1576296/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1557988/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1535129/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1515287/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:1494621/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGAATGATGTTGACTATTTc  >  1:311641/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGCAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:595868/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCGTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:477074/1‑65 (MQ=255) cTTAAATGGATTAGTTTCCTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTc  >  1:330427/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CTTAAATGGATTAGTTTCTTTGTGGAAAAGTAACTGATGTTATAATGTATGATGTTGACTATTTC  >  W3110S.gb/1051276‑1051340

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑