Missing coverage evidence...
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TTGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGCC  >  W3110S.gb/1056310‑1056356                                               | ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:760260/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:206921/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:278732/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:37835/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:515923/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:56318/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:597453/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:616198/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:619911/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:720115/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:747474/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1851388/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:762957/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:76888/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:770164/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:790889/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:844027/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:844529/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:898106/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:933275/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:977547/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1409257/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1024601/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1027667/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1171897/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1191647/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1312073/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:132804/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1367014/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1372729/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1382408/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:101200/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1461882/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1473822/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1628563/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1635523/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:166713/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1689545/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1697304/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1697974/1‑47 (MQ=255) ttGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGcc  >  1:1819656/1‑47 (MQ=255)                                               | TTGCAGCAACGCATTAATCTTCAGGCTTTGTGCGGTGAGCATTCGCC  >  W3110S.gb/1056310‑1056356

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑