Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1067750	1067790	41	72 [0]	[0] 73	wrbA	predicted flavoprotein in Trp regulation

ATAATTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCA  >  W3110S.gb/1067686‑1067749                                                                | ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:383109/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:654370/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:624948/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:497629/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:486872/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:477316/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:466130/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:46024/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:456087/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:701933/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:381650/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:370953/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:363927/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:361106/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1005030/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:308500/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:298659/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:341647/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:702133/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:709364/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:738965/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:751362/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:788450/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:800621/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:811713/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:81650/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:853254/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:898948/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:905321/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:908298/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:910421/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:9953/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:995722/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1193090/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1539525/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:292619/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1487740/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1474/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1364999/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1354332/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1283686/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1280447/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1524739/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1160054/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:115041/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1115064/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1059919/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1043588/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1041835/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1020251/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1778333/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:283406/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:244953/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:244384/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:215203/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1877141/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1825203/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1813716/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:179897/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1744494/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1727933/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1726755/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1656333/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:164108/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1585682/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTACa  <  1:800954/64‑1 (MQ=255) ataatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGAGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:978281/64‑1 (MQ=255)  taatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:735685/63‑1 (MQ=255)   aatTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:731898/62‑1 (MQ=255)    atTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:558848/61‑1 (MQ=255)            gctgcgTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:1545546/53‑1 (MQ=255)                           gggACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCa  <  1:990048/38‑1 (MQ=255)                                                                | ATAATTCCTGCGCTGCGTAGCCAATAGGGACAATTACCATGCCGTGATGCGCAAGGGTCGTCCA  >  W3110S.gb/1067686‑1067749

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑