Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1084364	1084417	54	34 [0]	[0] 20	ycdB	conserved hypothetical protein

TGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGT  >  W3110S.gb/1084300‑1084363                                                                | tgtaTGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1560206/61‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:598893/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:236750/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:249581/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:306143/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:309123/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:391178/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:46111/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:500895/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:206149/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:6207/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:63173/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:778381/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:863210/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:902724/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:951297/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:985131/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1476551/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1119211/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1144723/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1194241/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1272669/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1402780/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1433257/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1435403/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1070650/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1494426/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1579749/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1788809/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1804456/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1810791/64‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1831855/64‑1 (MQ=255)         gcgTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:1228555/56‑1 (MQ=255)          cgTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGt  <  1:477283/55‑1 (MQ=255)                                                                | TGGATGCGGCGTTATGTCATGGTGATGTGTTGCTACAGATTTGCGCCAACACCCAGGACACGGT  >  W3110S.gb/1084300‑1084363

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑