Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1096600	1096710	111	63 [0]	[0] 48	ycdU	predicted inner membrane protein

TTCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTGGGG  >  W3110S.gb/1096536‑1096599                                                                | ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:387935/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1631978/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1703424/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1773719/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1788706/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1822383/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:186501/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:186771/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1881329/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:226765/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:233626/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:29727/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:34355/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1027201/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:439241/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:467418/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:551389/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:552976/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:570632/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:644590/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:646591/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:733392/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:784250/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:788152/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:821961/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:879941/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1542140/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1160729/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1241546/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1605357/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:109882/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1087949/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1308152/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1322197/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:132740/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1343262/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1055131/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1030681/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:143773/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:147206/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1476869/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1003705/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1508064/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1514422/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGGTgggg  <  1:434250/64‑1 (MQ=255) ttCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATCAGTTgggg  <  1:537748/64‑1 (MQ=255) atCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:587320/63‑1 (MQ=255)  tCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:791197/63‑1 (MQ=255)  tCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1107910/63‑1 (MQ=255)  tCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:517326/63‑1 (MQ=255)  tCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1147975/63‑1 (MQ=255)  tCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:624194/63‑1 (MQ=255)  tCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:617408/63‑1 (MQ=255)  tCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:593682/63‑1 (MQ=255)  tCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1200060/63‑1 (MQ=255)  tCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1292653/63‑1 (MQ=255)  tCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1295883/63‑1 (MQ=255)  tCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1416107/63‑1 (MQ=255)  tCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:210998/63‑1 (MQ=255)  tCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGGCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1886063/63‑1 (MQ=255)             ctctGGTGGCAGGATTCCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:1484345/52‑1 (MQ=255)                              cTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:782805/35‑1 (MQ=255)                              cTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTgggg  <  1:94786/35‑1 (MQ=255)                                                                | TTCTTACACAACCTCTGGTGGCAGGATTTCTGTCGTTAATCATGTTGAGTGCAATGAGTTGGGG  >  W3110S.gb/1096536‑1096599

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑