Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1134078	1134153	76	25 [0]	[0] 80	[flgD]–[flgE]	[flgD],[flgE]

TGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGATCT  >  W3110S.gb/1134027‑1134077                                                   | tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:1576444/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:956001/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:925128/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:901717/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:900392/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:729859/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:715307/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:59999/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:530905/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:529356/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:280024/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:253877/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:1733684/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:106423/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:1506437/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:1367909/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:1352737/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:1318820/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:125408/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:1150701/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:1131386/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:1121278/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:1119122/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:1104681/51‑1 (MQ=255) tGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGAtct  <  1:1074047/51‑1 (MQ=255)                                                   | TGCTCTGGTGCAGGGTGTGATCCGCGGCAACAGCGGTAATACGCTGGATCT  >  W3110S.gb/1134027‑1134077

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑