Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1137236	1137481	246	20 [0]	[0] 13	flgH	flagellar protein of basal‑body outer‑membrane L ring

ATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCA  >  W3110S.gb/1137171‑1137235                                                                 | aTTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:1000818/65‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:997034/65‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:1083358/65‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:986708/65‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:128611/65‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:1545905/65‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:161440/65‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:1632081/65‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:1758383/65‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:926430/65‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:683751/65‑1 (MQ=255)  tttCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:1051178/64‑1 (MQ=255)  tttCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:95311/64‑1 (MQ=255)  tttCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:630802/64‑1 (MQ=255)  tttCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:1247984/64‑1 (MQ=255)                gTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:486199/50‑1 (MQ=255)                  gCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:10784/48‑1 (MQ=255)                   cTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:882353/47‑1 (MQ=255)                      tCACTAACCGGCGGGGCCGGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:534175/44‑1 (MQ=38)                              cGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa  <  1:331998/36‑1 (MQ=255)                                                                 | ATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCA  >  W3110S.gb/1137171‑1137235

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑