Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1139279	1139355	77	7 [0]	[0] 150	flgJ	muramidase

GCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCAGAACAACCATTGCCAGAGGAGTCCACGCCAG  >  W3110S.gb/1139214‑1139278                                                                 | gCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCAGAACAACCATTGCCAGAGGAGTCCACGCcag  <  1:1082769/65‑1 (MQ=255) gCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCAGAACAACCATTGCCAGAGGAGTCCACGCcag  <  1:1253979/65‑1 (MQ=255) gCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCAGAACAACCATTGCCAGAGGAGTCCACGCcag  <  1:1471909/65‑1 (MQ=255) gCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCAGAACAACCATTGCCAGAGGAGTCCACGCcag  <  1:1499937/65‑1 (MQ=255) gCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCAGAACAACCATTGCCAGAGGAGTCCACGCcag  <  1:300112/65‑1 (MQ=255) gCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCAGAACAACCATTGCCAGAGGAGTCCACGCcag  <  1:814032/65‑1 (MQ=255)  cTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCAGAACAACCATTGCCAGAGGAGTCCACGCcag  <  1:1647754/64‑1 (MQ=255)                                                                 | GCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCAGAACAACCATTGCCAGAGGAGTCCACGCCAG  >  W3110S.gb/1139214‑1139278

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑