Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1139941	1140252	312	21 [0]	[0] 11	[flgK]	[flgK]

TAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCT  >  W3110S.gb/1139877‑1139940                                                                | tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCTGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:1593873/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:1619623/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:987352/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:831653/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:827059/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:787747/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:765951/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:591746/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:419931/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:1676227/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:1649310/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:1636548/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:1582739/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:1498352/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:1446175/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:1268872/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:1190847/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:1182131/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:1143418/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:1080540/64‑1 (MQ=255) tAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGGCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCt  <  1:1067393/64‑1 (MQ=255)                                                                | TAATCTGTTCTGAATAACTCAAGTCCGGCGGGTCGCTGCCGATAATACTCTGTAATTGAAGGCT  >  W3110S.gb/1139877‑1139940

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑