Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1147307	1147420	114	41 [0]	[0] 89	rluC	23S rRNA pseudouridylate synthase

CCAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACC  >  W3110S.gb/1147242‑1147306                                                                 | ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:492891/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:200857/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:259201/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:279925/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:317063/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:319634/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:429865/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:436431/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:467289/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:46878/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:49159/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:198688/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:662854/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:720381/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:727850/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:742730/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:783064/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:844424/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:87573/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:892886/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:996442/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1408843/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1061835/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1094255/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1110423/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1132661/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1145578/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1146789/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1193898/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1234903/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1260176/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1018690/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1414199/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1467464/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1552082/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1556450/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1619273/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1692223/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1703207/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1854073/1‑65 (MQ=255) ccAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATCGCCTTTGACGATCGCTACGGTGAcc  >  1:1711119/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CCAGATCCGTGTGCATACACAATATGCGGGTCATCCGATTGCCTTTGACGATCGCTACGGTGACC  >  W3110S.gb/1147242‑1147306

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑