Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1160782	1160796	15	61 [0]	[0] 42	ptsG	fused glucose‑specific PTS enzyme IIBC components

TCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAG  >  W3110S.gb/1160717‑1160781                                                                 | tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAATGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1158487/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGGAACTGGGCGCAg  <  1:1119483/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:65495/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:22538/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:306052/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:318665/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:342456/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:396312/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:431382/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:447883/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:451117/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:496546/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:537851/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:606922/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:610495/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:262884/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:660733/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:660734/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:697805/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:728809/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:782849/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:799533/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:807171/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:808905/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:913912/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:917169/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:92405/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:972295/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:209206/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1258858/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1266215/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1326609/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1328283/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1419927/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:142298/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1472077/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1551437/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1564301/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1570065/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1578472/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1210785/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1196887/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1679841/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1717610/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1739782/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1770610/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1814497/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1847740/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1869660/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCAGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:90528/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGTCAGAGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:701678/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGGCAGCGTTGCTGATGTGTCTAACGTGGATCCGGCCGGCCGGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:873099/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGGCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1675565/65‑1 (MQ=255) tCTGCGCGGCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:287037/65‑1 (MQ=255)  cTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:255266/64‑1 (MQ=255)      gcgTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:956114/60‑1 (MQ=255)          cAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1153263/56‑1 (MQ=255)               ttGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1585903/51‑1 (MQ=255)                      tgtgTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGATACTGGGCGCAg  <  1:1123497/44‑1 (MQ=255)                      tgtgTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCGGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:535186/44‑1 (MQ=255)                        tgtCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAg  <  1:1541861/42‑1 (MQ=255)                                                                 | TCTGCGCGTCAGCGTTGCTGATGTGTCTAAAGTGGATCAGGCCGGCCTGAAGAAACTGGGCGCAG  >  W3110S.gb/1160717‑1160781

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑