Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1175899	1175988	90	49 [0]	[0] 7	ycfT	predicted inner membrane protein

GCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGGGTGG  >  W3110S.gb/1175834‑1175898                                                                 | gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTTAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1293760/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCGGAATGCGATGggtgg  <  1:1695472/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:600693/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:21873/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:250930/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:322141/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:345143/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:412433/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:503670/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:508625/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:510728/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:528469/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:580015/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:208686/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:604755/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:613018/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:680024/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:683545/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:739406/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:798336/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:883500/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:915302/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:961514/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:998576/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1384482/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1121122/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1216147/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1228236/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1236573/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1261739/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1281424/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1289883/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1357388/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1094325/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1389247/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1488957/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1540943/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1716361/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1773377/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1779236/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1819800/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1822851/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTAAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:840566/65‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTTCATTTGAGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1730229/65‑1 (MQ=255)  cGTGTTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1488862/64‑1 (MQ=255)  cGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1248199/64‑1 (MQ=255)  cGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:871861/64‑1 (MQ=255)  cGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:1207949/64‑1 (MQ=255)        gcGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGggtgg  <  1:596797/58‑1 (MQ=255)                                                                 | GCGTGCTGCGTTCATTTGCGCAAGCAGAGTTAAGCTGAATATTTCAACCAGAATGCGATGGGTGG  >  W3110S.gb/1175834‑1175898

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑