Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1176951	1177191	241	30 [0]	[0] 26	[lolC]	[lolC]

CGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCA  >  W3110S.gb/1176886‑1176950                                                                 | cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGCCGCTCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:641075/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGCCGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:1559273/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:1822384/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:720135/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:678532/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:604498/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:600479/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:569426/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:459250/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:439814/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:435827/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:434166/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:377045/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:360163/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:222673/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:1001281/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:178190/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:1703629/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:1576941/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:1477807/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:1469317/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:146662/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:1451743/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:1434442/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:1340060/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:1250127/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:1167115/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:1158140/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTAACCCa  >  1:784380/1‑65 (MQ=255) cGATTGATTTACGGGGGCCTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCa  >  1:205/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CGATTGATTTACGGGGGCTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCAGACGTTTACCCA  >  W3110S.gb/1176886‑1176950

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑