Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1218112	1218196	85	62 [0]	[1] 23	ymgB	hypothetical protein

AGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTAA  >  W3110S.gb/1218047‑1218111                                                                 | aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTCTCTTaa  <  1:1351278/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:5733/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:223248/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1000738/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:296395/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:307824/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:319204/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:367042/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:370446/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:390094/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:392188/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:410198/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:417368/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:451055/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:484835/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:529515/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:264444/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:595538/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:6152/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:638/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:679186/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:6859/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:693086/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:714926/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:831636/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:833877/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:850856/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:871566/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:987093/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1728620/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1029312/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1081929/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1137039/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1173502/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1259375/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1264241/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1264415/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1411058/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1468843/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1473588/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:148702/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1498704/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1503231/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1558097/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:158424/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1551982/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:214363/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:15935/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1604836/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1612541/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1706909/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1677412/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1661185/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:161360/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAAAATTATCTTaa  <  1:1490845/65‑1 (MQ=255)  gggCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1008032/64‑1 (MQ=255)  gggCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:1342943/64‑1 (MQ=255)   ggCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:488406/63‑1 (MQ=255)      aGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:56108/60‑1 (MQ=255)             cACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:268301/53‑1 (MQ=255)                             tCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:332274/37‑1 (MQ=255)                              cAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTaa  <  1:326404/36‑1 (MQ=255)                                                                 | AGGGCAGGCTGTCACCAATTTAATGCTTTCAGGCGATAATGTTAATAATAAAAATATTATCTTAA  >  W3110S.gb/1218047‑1218111

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑