Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1228588	1228687	100	74 [0]	[0] 126	[ycgK]	[ycgK]

TGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGA  >  W3110S.gb/1228523‑1228587                                                                 | tGTTATTTATGTGTCGTTAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:52363/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTGGTCATTAACCTCTTGa  <  1:869635/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:394191/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:577390/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:571889/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:504430/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:502561/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:494996/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:418949/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:407977/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:590879/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:328590/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:310189/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:259636/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:221318/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:215018/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1848827/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1036737/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:645184/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:689709/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:722897/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:73078/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:767168/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:779285/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:785052/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:860512/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:877708/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:896642/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:914768/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:921708/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:93559/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:938468/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1089415/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1053421/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1422536/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1337545/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:107016/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1336135/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:129351/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:129007/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1290042/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1477356/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1265432/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1210538/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1198554/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:11914/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1177591/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1172524/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:113502/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1623936/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:181440/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:179012/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1749870/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1724920/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1674813/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1665070/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1651653/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1498902/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1587507/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1584268/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1549448/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1528819/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1016897/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGCCATTAACCTCTTGa  <  1:729821/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTAGTCATTAACCTCTTGa  <  1:795483/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATACGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1787860/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCGTGAGTGACGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:70009/65‑1 (MQ=255) tGTTATTTATGTGTCCTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:991522/65‑1 (MQ=255)  gTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:1841569/64‑1 (MQ=255)  gTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:535460/64‑1 (MQ=255)  gTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:451049/64‑1 (MQ=255)   ttatttatGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:635971/63‑1 (MQ=255)          tgtgTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:520597/56‑1 (MQ=255)                               tttACATTAAGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGa  <  1:767083/35‑1 (MQ=255)                                                                 | TGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGA  >  W3110S.gb/1228523‑1228587

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑