Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1243600 1244360 761 34 [0] [0] 26 [cvrA]–[ldcA] [cvrA],[ldcA]

CAGAATAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGA  >  W3110S.gb/1243544‑1243599
                                                       |
cAGAATAGGAATGCCAAGTCGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:1485764/56‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAGGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:1322876/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:848917/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:432199/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:44160/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:443034/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:557625/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:628327/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:751714/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:768294/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:1098542/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:895921/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:90770/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:922967/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:938224/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:991669/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:994396/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:1381440/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:1067008/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:1115911/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:1129138/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:120496/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:1301951/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:132989/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:1363170/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:153309/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:1580586/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:1610878/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:176520/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:1853860/52‑1 (MQ=255)
    aTAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAAATAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:348787/52‑1 (MQ=255)
     tAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:42580/51‑1 (MQ=255)
          aTGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:328829/46‑1 (MQ=255)
                  aCGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGa  <  1:931257/38‑1 (MQ=255)
                                                       |
CAGAATAGGAATGCCAAGACGGGAAGAAAATGAACTAAGTAATATACTGCTGGTGA  >  W3110S.gb/1243544‑1243599

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: