Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1244426	1244480	55	29 [0]	[0] 122	ldcA	L,D‑carboxypeptidase A

CGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAC  >  W3110S.gb/1244361‑1244425                                                                 | cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:200105/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:966433/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:942792/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:872638/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:821219/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:745088/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:715516/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:671581/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:654392/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:617342/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:610367/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:484110/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:236130/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:205858/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:1032372/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:1840156/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:1626217/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:1535814/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:1371988/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:1313235/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:1300769/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:1291164/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:1168364/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:1139899/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:1126814/65‑1 (MQ=255) cGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:1109631/65‑1 (MQ=255)  gggTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:1650259/64‑1 (MQ=255)  gggTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:451717/64‑1 (MQ=255)           tgttgGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAc  <  1:1583684/55‑1 (MQ=255)                                                                 | CGGGTCATGTTGTTGGCGAGCCACCAGTGCCTGCCAGTCAATATCTGCCAGTAAACGACTGGCAC  >  W3110S.gb/1244361‑1244425

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑