Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1256449	1256701	253	58 [0]	[0] 17	ycgV	predicted adhesin

TGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCAA  >  W3110S.gb/1256383‑1256448                                                                  | tGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAA‑CCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1435321/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTTAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:597457/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:526149/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1008808/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1816987/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1881271/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:27790/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:351872/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:387689/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:404554/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:412225/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:413528/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:413626/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:484592/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:485047/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:521122/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:178408/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:532523/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:600490/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:601390/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:607602/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:64609/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:708057/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:721956/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:750893/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:77301/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:78965/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:874361/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:878009/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1361136/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1035266/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1035646/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:108055/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:108255/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1186029/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1200921/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1209636/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1272793/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1304278/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1331660/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1356040/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1359866/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1774463/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:138417/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1417143/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1422020/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1427186/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1463603/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1495937/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1535829/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1539247/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1571240/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1573040/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1627903/65‑1 (MQ=255)  gTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1740221/65‑1 (MQ=255)    ctcCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:1208977/63‑1 (MQ=255)       cGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:728015/60‑1 (MQ=255)            aTTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCaa  <  1:433293/55‑1 (MQ=255)                                                                  | TGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCAA  >  W3110S.gb/1256383‑1256448

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑