Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1290969	1291018	50	46 [0]	[0] 21	rssA	conserved hypothetical protein

AAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCC  >  W3110S.gb/1290905‑1290968                                                                | aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:62099/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1035085/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1820827/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:192704/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:256960/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:280587/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:32851/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:394677/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:419068/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:448910/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:513898/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:561784/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1770414/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:633754/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:643372/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:65204/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:707436/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:743914/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:745919/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:750903/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:795831/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:823890/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:957408/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1486457/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1047508/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1106968/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1111085/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1126955/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1157607/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1284895/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1314679/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1350700/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1374814/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1454737/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1478778/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1753640/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1512838/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1546043/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1596768/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1646629/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1720120/64‑1 (MQ=255) aaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTGGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1601954/64‑1 (MQ=255)  aaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:468995/63‑1 (MQ=255)  aaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1583674/63‑1 (MQ=255)  aaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTGCGCTGGTGGGCGCTGcc  <  1:1699495/63‑1 (MQ=255)             tGAAATTGATATCGTTTCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTTGTGGGCGCTGcc  <  1:1534316/52‑1 (MQ=39)                                                                | AAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCC  >  W3110S.gb/1290905‑1290968

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑