Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1296581	1296714	134	43 [0]	[0] 26	ychG ychG	ECK1234:JW5883+JW1227:b4573; hypothetical protein ECK1234:JW5883:b1240; hypothetical protein, N‑ter fragment

AAAAAGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTG  >  W3110S.gb/1296516‑1296580                                                                 | aaataGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:496793/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:327903/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1726644/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1007620/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1734587/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:173987/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1766041/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1830902/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1847915/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:303627/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1673174/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:399468/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:624295/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:666383/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:711881/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:884100/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:765982/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:810239/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1289607/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:973773/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:967666/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:935033/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:113572/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1136417/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1163896/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1285855/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1610510/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1291630/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1335953/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1359709/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1386756/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1447081/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1512280/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1608418/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGGCTg  <  1:770156/65‑1 (MQ=255) aaaaaGCTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1048162/65‑1 (MQ=255)  aaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:561167/64‑1 (MQ=255)  aaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1478621/64‑1 (MQ=255)  aaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGGCTg  <  1:172903/64‑1 (MQ=255)   aaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1010442/63‑1 (MQ=255)           aGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:105915/55‑1 (MQ=255)               cGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:1104260/51‑1 (MQ=255)                     aGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg  <  1:731156/45‑1 (MQ=255)                                                                 | AAAAAGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTG  >  W3110S.gb/1296516‑1296580

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑