Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1311983 1312137 155 165 [0] [0] 13 [kch] [kch]

Only 100 of 165 total aligned reads displayed.

AATGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCA  >  W3110S.gb/1311918‑1311982
                                                                |
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTGGCCCAGTGACTCa  <  1:787477/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:672308/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:691212/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:63629/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:594847/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:587614/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:567160/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:557217/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:549201/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:533470/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:518852/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:498654/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:468259/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:459404/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:445806/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:431916/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:430185/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:367505/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:356123/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:296090/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:25810/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1007065/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:228437/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:191429/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:780095/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:982490/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:945301/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:931119/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:917245/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:883448/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:877435/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:85921/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:851687/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:814867/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:811459/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:808917/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:67701/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:772467/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:752383/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:750750/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:748899/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:728194/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:725261/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:70914/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:702439/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:701227/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:24519/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1308681/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:147600/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1461676/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1438339/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1419807/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1407932/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1403649/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1391772/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1375747/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1372559/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1360544/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1340393/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:133657/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1860625/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:122925/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:122792/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1188384/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1170135/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1169191/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1165015/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1148211/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:112578/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1119616/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1065287/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1013939/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1764168/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1862966/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1857697/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1845936/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1819717/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1797881/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1785319/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1778852/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1495294/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:174390/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1739845/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1704390/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1497038/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1619333/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1605600/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1584119/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1518107/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1730863/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1519371/65‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTGCCGAAGGGGCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:314326/65‑1 (MQ=255)
 aTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1567025/64‑1 (MQ=255)
 aTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:25200/64‑1 (MQ=255)
 aTGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:296506/64‑1 (MQ=255)
           gAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTTTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:470738/54‑1 (MQ=255)
               ggTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:280431/50‑1 (MQ=255)
                 tCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1489329/48‑1 (MQ=255)
                   aCCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:1114954/46‑1 (MQ=255)
                              tgttgCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCa  <  1:887688/35‑1 (MQ=255)
                                                                |
AATGTCGTGCCGAAGGGTCACCCATAAATTTGTTGCTGTTTGTTTGAATGTAGCCCAGTGACTCA  >  W3110S.gb/1311918‑1311982

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: