Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1357189	1357341	153	61 [0]	[0] 165	sapA	predicted antimicrobial peptide transporter subunit

AGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGTT  >  W3110S.gb/1357124‑1357188                                                                 | aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:463162/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:936492/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:923854/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1880833/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:190178/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:201579/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:204089/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:208843/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:294650/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:307947/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:316005/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:317683/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:434391/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:444253/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1873454/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:509738/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:536585/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:599864/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:662832/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:669442/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:687732/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:70173/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:798461/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:809046/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:820383/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:922821/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:896629/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1278261/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1078474/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1079267/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1088687/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1092242/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1101899/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1159502/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1165718/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1172965/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1192849/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:120356/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1223762/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1226774/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1267589/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:184306/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1286166/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1390535/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1414347/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1507480/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1621638/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1662177/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1676475/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1745241/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:174809/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:94206/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1805249/65‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1834173/65‑1 (MQ=255) aGGGCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:564279/65‑1 (MQ=255)        cagGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1875910/58‑1 (MQ=255)          ggAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1784606/56‑1 (MQ=255)                  gTGACAATCAATAACAAAATGCGTCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:869657/48‑1 (MQ=255)                       aatcaatAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1058015/43‑1 (MQ=255)                       aatcaatAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGtt  <  1:1873856/43‑1 (MQ=255)                            atAAGAAAATGCGGCGTAAGGTGTAGTTAATCATGGtt  <  1:95688/38‑1 (MQ=25)                                                                 | AGGTCAGCAGGAACAAGGTGACAATCAATAACAAAATGCGGCGTAAGGTGAAGATAATCATGGTT  >  W3110S.gb/1357124‑1357188

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑