Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1378531	1378644	114	48 [0]	[0] 84	[ycjR]–[ycjS]	[ycjR],[ycjS]

AAGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTACC  >  W3110S.gb/1378466‑1378530                                                                 | aaGGGCGTATCCGGGCGTAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:759269/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTTcc  <  1:815330/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:69552/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1013589/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:327691/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:344020/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:372250/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:379462/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:46400/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:563858/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:572290/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:573646/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:578363/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:634445/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:303873/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:739122/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:758203/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:763832/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:765404/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:791068/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:866583/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:945759/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:960644/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1446498/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1036304/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1122865/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1233932/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1263871/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1274551/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1280142/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1283306/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1290354/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1329747/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1330229/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1361515/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1472018/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1495306/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1559601/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1562768/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1578968/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1670181/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1703332/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:1864852/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:197317/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:211921/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGGACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:749909/65‑1 (MQ=255) aaGGGCGGATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:312280/65‑1 (MQ=255)  aGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTAcc  <  1:225577/64‑1 (MQ=255)                                                                 | AAGGGCGTATCCGGGCGGAAGATCCTGCCCAGGCGTACCGTGATTCGTTGGCCTGGTTGCGTACC  >  W3110S.gb/1378466‑1378530

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑