Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1438026	1438040	15	53 [0]	[0] 70	ompN	outer membrane pore protein N, non‑specific

GCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTC  >  W3110S.gb/1437961‑1438025                                                                 | gcgccAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:243045/4‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGCCCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:960149/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCCCCGTTTTc  >  1:1707891/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:613064/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:320576/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:356508/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:360685/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:361167/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:408250/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:43381/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:441849/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:461443/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:482903/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:493761/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:583080/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:989864/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:674566/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:740830/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:743293/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:821500/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:82218/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:845251/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:88398/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:893984/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:920500/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:987646/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1010133/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1408550/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1016110/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1018914/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1074436/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1088563/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:110296/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1141092/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1166511/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1169221/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1171990/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1308175/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1379202/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1401340/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:318614/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1459041/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:146340/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1495025/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1515233/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1564248/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1640810/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1672607/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1715628/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1717246/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1764648/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:1867127/1‑65 (MQ=255) gCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGAACCCAGCCGTCACCGTTTTc  >  1:601473/1‑65 (MQ=255)                                                                 | GCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTC  >  W3110S.gb/1437961‑1438025

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑