Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1456535	1456870	336	83 [0]	[0] 124	[paaA]–paaB	[paaA],paaB

AGAGGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGCC  >  W3110S.gb/1456470‑1456534                                                                 | agagGCTCGACGCCAATCGTAATGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:697330/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:698261/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1615924/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1617301/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1643569/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1671533/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:854619/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:84979/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:82635/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1737744/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:725559/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:712258/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1803160/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1832011/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1008048/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1879511/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:193573/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:203148/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:697632/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:284205/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:301788/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:312830/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:36134/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:531980/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:48589/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:466372/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1164433/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1182881/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1236752/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:952659/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:939789/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:138189/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:92814/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1386239/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1165641/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1422390/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1431719/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1436688/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1454462/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1457313/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1482375/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1492966/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1517743/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1145462/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1524535/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:112773/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1538443/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1547048/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1594092/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACCCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1639670/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACCCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1637617/65‑1 (MQ=255) agagGCGCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1615629/65‑1 (MQ=255) agagGCGCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1648915/65‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:912828/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:794080/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:576468/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:542424/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:89872/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:500580/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:988987/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:102597/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1689929/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1070996/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1328560/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1382526/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1400322/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1687354/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1689635/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:438999/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1717257/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1772156/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:282755/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:298874/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:377109/64‑1 (MQ=255)  gagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:428360/64‑1 (MQ=255)   agGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:184147/63‑1 (MQ=255)   agGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:388988/63‑1 (MQ=255)   agGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:955679/63‑1 (MQ=255)     gCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1629796/61‑1 (MQ=255)         gACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:174323/57‑1 (MQ=255)         gACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1296746/57‑1 (MQ=255)                       aGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:946072/43‑1 (MQ=255)                            gggAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:380794/38‑1 (MQ=255)                                                                 | AGAGGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGCC  >  W3110S.gb/1456470‑1456534

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑