Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	100239	100311	73	57 [0]	[0] 30	murG	N‑acetylglucosaminyl transferase

TGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACC  >  W3110S.gb/100174‑100238                                                                 | tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:637638/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1868734/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:22886/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:230263/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:30866/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:320307/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:372138/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:441463/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:461973/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:481310/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:48614/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:528750/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:620819/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:230155/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:682892/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:689576/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:739228/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:744729/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:759745/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:809050/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:821280/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:853179/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:898448/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:949763/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:997377/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1287754/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1067618/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1079227/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1098327/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1105759/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1115838/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1120933/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1145382/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1171471/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1181449/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1202942/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1857516/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1319386/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1334337/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1417604/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1715332/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:167382/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1493239/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1568823/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1611600/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTGCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1016209/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTGCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1530878/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGGTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:609360/65‑1 (MQ=255) tGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGGTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:795913/65‑1 (MQ=255) gggACGTGAAGGGCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1114971/64‑1 (MQ=255)  ggACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:686982/64‑1 (MQ=255)  ggACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:509166/64‑1 (MQ=255)  ggACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:185538/64‑1 (MQ=255)      gTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGGGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:894348/60‑1 (MQ=255)                    cGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:677477/46‑1 (MQ=255)                          cTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:1472124/40‑1 (MQ=255)                              tAGTGGGTGGTTCGCAGGGCGCACGCATTCTTAAcc  <  1:204848/36‑1 (MQ=255)                                                                 | TGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACC  >  W3110S.gb/100174‑100238

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑