Missing coverage evidence...
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TACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGC  >  W3110S.gb/1496884‑1496946                                                               | tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAGATTCTTCCCGc  >  1:518520/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:561692/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1837173/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1878659/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:210522/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:247416/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:250288/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:428893/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:442027/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:454947/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:469924/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:476035/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1804741/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:58121/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:656848/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:680862/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:685818/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:698344/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:70755/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:71521/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:756214/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:842452/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:931662/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:982597/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1448309/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1092581/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1111896/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1120652/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1157/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1176695/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1226307/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:125723/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:128941/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1301297/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1305953/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1333104/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1418972/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1032111/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:144995/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1471945/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1499846/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1510380/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1555938/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1586877/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:170163/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:1707695/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:172626/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGc  >  1:177864/1‑63 (MQ=255) tACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCACGc  >  1:294211/1‑63 (MQ=255)                                                               | TACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGC  >  W3110S.gb/1496884‑1496946

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑