Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1498047	1498166	120	39 [0]	[0] 62	ydcJ	conserved hypothetical protein

GGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCC  >  W3110S.gb/1497982‑1498046                                                                 | ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:608251/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:177451/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:188116/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:271324/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:302764/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:385956/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:461520/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:462367/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:5250/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:527075/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1765290/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:691832/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:747853/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:762216/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:814105/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:905793/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:913510/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:970050/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:976280/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:997552/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1493838/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1084298/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1107382/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1154676/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:123028/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:127111/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1311442/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1340807/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1374645/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:147893/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1014769/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1563087/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1598359/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1625769/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1629106/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1631423/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1634886/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1675947/1‑65 (MQ=255) ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTcc  >  1:1754238/1‑65 (MQ=255)                                                                 | GGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCC  >  W3110S.gb/1497982‑1498046

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑