Missing coverage evidence...
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ACTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTG  >  W3110S.gb/1520342‑1520406                                                                 | aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:427288/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:18253/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:255892/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:268882/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:320148/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:331306/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:353554/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:354779/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:397981/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1755901/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:441930/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:54608/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:581211/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:601870/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:674685/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:714372/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:928680/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1047049/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1090596/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:172173/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1710089/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1589147/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1491976/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1099666/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1430063/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1332539/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1115794/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1170192/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1145412/65‑1 (MQ=255) aCTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1128049/65‑1 (MQ=255)  cTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1268960/64‑1 (MQ=255)  cTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:472169/64‑1 (MQ=255)  cTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1453464/64‑1 (MQ=255)  cTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1024501/64‑1 (MQ=255)   tACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1726095/63‑1 (MQ=255)   tACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1796459/63‑1 (MQ=255)         aGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTg  <  1:1072978/57‑1 (MQ=255)                                                                 | ACTACGCCAGTCGCCAAACGAGGCATATCCCGTCACTACGCCGTTTTCCTCGCTCACCAGCACTG  >  W3110S.gb/1520342‑1520406

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑