Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1546701	1546808	108	56 [0]	[0] 59	yddK	hypothetical protein

TTAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTA  >  W3110S.gb/1546636‑1546700                                                                 | ttAATGTCTGGACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1181764/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGTATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1753304/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:488249/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1778423/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1852181/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1862010/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1871255/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:207880/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:224215/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:267675/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:3108/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:321256/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:333990/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:392999/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:447127/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:484527/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1757338/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:518086/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:547418/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:569294/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:719138/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:727523/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:728221/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:790396/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:794788/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:88716/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:92345/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:954878/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:973470/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1479175/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:103253/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1040585/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:105714/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1085969/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1188090/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1199533/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1230408/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1260170/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1314109/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1322800/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1327396/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1403003/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1456270/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1007014/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1488592/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1497946/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1500194/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1526319/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1581742/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1583996/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1587669/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1618081/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1662709/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1756696/65‑1 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTCGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:1484382/65‑1 (MQ=255)  tAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTta  <  1:444940/64‑1 (MQ=255)                                                                 | TTAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTA  >  W3110S.gb/1546636‑1546700

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑