Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1554378	1554395	18	78 [0]	[0] 118	yddM	predicted DNA‑binding transcriptional regulator

GCAAACTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCCGGGCGGG  >  W3110S.gb/1554314‑1554377                                                                | gCAAACTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:678162/64‑1 (MQ=255) gCAAACTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1566732/64‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:497478/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:601580/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:567711/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:563581/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:554819/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:552200/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:5097/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:509214/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:658187/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:476694/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:320872/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:320072/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:312940/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:304409/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:300225/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:289627/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:281808/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1005058/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:821286/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:993873/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:983932/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:967518/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:950777/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:93204/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:912121/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:874269/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:863479/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:65750/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:78270/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:7745/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:747795/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:745162/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:72178/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:718079/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:708462/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:275129/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1416358/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1615627/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1604896/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:252680/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1573569/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1548647/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1519339/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1477087/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1417194/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1603033/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1408956/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1365212/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:123554/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1233841/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1232554/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1196904/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1137813/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1016747/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1772053/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:209614/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1883158/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1819917/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1813334/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1810050/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1777097/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1776228/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1773870/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1623092/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1746399/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1732759/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1695382/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1691386/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1681185/62‑1 (MQ=255)   aaaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1634412/62‑1 (MQ=255)    aaCTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:758103/61‑1 (MQ=255)             aGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1475606/52‑1 (MQ=255)             aGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:275434/52‑1 (MQ=255)                cTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:102123/49‑1 (MQ=255)                             cGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:771070/36‑1 (MQ=255)                             cGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCcgggcggg  <  1:1418680/36‑1 (MQ=255)                                                                | GCAAACTCGCGCAGGCTGACATTAAGTTCGTCCAGTGATTCCTGAATAATGTCCCCCGGGCGGG  >  W3110S.gb/1554314‑1554377

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑