Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	107946	108085	140	85 [0]	[0] 11	secM	regulator of secA translation

GTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACT  >  W3110S.gb/107883‑107945                                                               | gTCAATTGGCCTTGCTGGATGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1263495/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGACGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:56657/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCTAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTAATCCGTTGATTACt  <  1:455526/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:30067/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:464713/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:462624/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:438057/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:412870/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:408173/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:389621/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:383628/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:512214/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:294580/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:271150/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:256687/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:237510/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:212396/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:21140/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:210672/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:206911/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1881835/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1870606/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:683529/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:98308/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:95184/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:851456/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:835057/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:818484/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:810516/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:808691/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:753985/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:725392/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:497699/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:674397/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:670808/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:646105/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:629662/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:605132/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:553458/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:549514/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:538899/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1039802/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:130385/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1414966/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1407413/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1060887/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1079328/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1360025/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1356333/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1333839/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1311369/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1448668/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1296130/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:120728/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1109389/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1116419/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1177207/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1174426/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1173374/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1163620/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1618602/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1038047/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1049481/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1772298/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1719677/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1704126/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1645773/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1633424/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1628413/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1604881/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1519737/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1517948/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1509545/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1496628/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1460975/63‑1 (MQ=255) gTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1457047/63‑1 (MQ=255)  tCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1364542/62‑1 (MQ=255)  tCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:800864/62‑1 (MQ=255)  tCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1180171/62‑1 (MQ=255)  tCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1366681/62‑1 (MQ=255)  tCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1873306/62‑1 (MQ=255)   cAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1788236/61‑1 (MQ=255)       tGGCCTTGCTGGAAGCTAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:119021/57‑1 (MQ=255)            ttGCTGGAAGCGAACAAACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1869908/52‑1 (MQ=255)                tGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACt  <  1:1090549/48‑1 (MQ=255)                                                               | GTCAATTGGCCTTGCTGGAAGCGAACACACGCCGCCCGAATTCGAACTATTCCGTTGATTACT  >  W3110S.gb/107883‑107945

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑