Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1555597 1555856 260 125 [0] [0] 3 [sfcA] [sfcA]

Only 100 of 125 total aligned reads displayed.

CGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCAA  >  W3110S.gb/1555532‑1555596
                                                                |
cgaaacaacTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:5031/4‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGTaa  >  1:1287152/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:339633/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:515675/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:514411/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:484288/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:459184/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:452538/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:448253/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:436957/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:426092/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:423848/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:407669/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:58750/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:338885/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:311248/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:30753/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:295046/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:294618/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:262516/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:250983/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:241117/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:235013/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:204791/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1885578/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1877594/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:764708/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:988600/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:986134/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:978341/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:975588/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:947479/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:947103/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:925508/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:911049/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:826280/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:824006/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:791274/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:785947/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:545742/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:750178/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:750111/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:742192/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:717603/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:69880/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:697276/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:669663/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:657584/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:633293/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:595466/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1846984/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1264654/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1401294/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1399159/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1362777/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1361216/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1360473/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1321218/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1312974/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:130201/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1290930/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1278566/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1268803/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1265020/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1405498/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:123732/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1226810/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1221220/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1202444/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1175874/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1172352/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1154438/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:113424/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1099815/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1088252/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:108366/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:161629/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1821783/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1815614/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1798653/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:178123/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1767172/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1764171/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1740412/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1695185/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1688720/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1671795/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1647631/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1001530/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1594450/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1587098/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1583121/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1539515/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1538346/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1522858/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1494164/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1451769/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1448080/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1433061/1‑65 (MQ=255)
cGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCaa  >  1:1408374/1‑65 (MQ=255)
                                                                |
CGTAACAACTGCAGCCTTCATAGTTCCTCCTTTTCGGATGATGTTCTGCATAGCAGGTGAGGCAA  >  W3110S.gb/1555532‑1555596

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: