Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1557940	1558126	187	91 [0]	[0] 12	[bdm]	[bdm]

CAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATGG  >  W3110S.gb/1557875‑1557939                                                                 | cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCCTGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:804480/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:279034/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:402855/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:393307/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:387985/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:387963/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:385720/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:37007/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:341831/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:329288/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:323486/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:308912/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:488576/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:256625/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:248357/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:245888/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:199341/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1861349/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1857582/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1841396/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1020211/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1776105/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:579590/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:997000/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:982863/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:982684/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:968966/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:952289/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:911643/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:845978/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:817225/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:638121/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:587509/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:409549/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:57879/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:566336/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:543419/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:538540/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:521862/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:51083/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:500992/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:500369/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1833775/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1359970/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1764819/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1175762/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1177294/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1509594/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1502799/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1497591/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1466703/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1179503/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:142731/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1375104/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1514157/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1347759/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1329922/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1305047/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1298276/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1272705/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1251490/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1183738/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1247015/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1199401/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1650402/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1758621/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1757332/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1756287/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:175431/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1752803/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1723213/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1722349/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1695362/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1685796/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1671776/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1642660/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1636235/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1626106/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1588958/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1579298/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1578701/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1564891/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1540669/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1529563/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGG‑CTTGCTCAATgg  <  1:103497/64‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAAGCCTTGCTCAATgg  <  1:455379/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGGGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:840028/65‑1 (MQ=255) cAGCTCCATGAGAATGTCATCTTAAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:1445042/65‑1 (MQ=255)  aGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCTAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:453247/64‑1 (MQ=255)  aGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:456709/64‑1 (MQ=255)        aTGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATgg  <  1:85566/58‑1 (MQ=255)                                                                 | CAGCTCCATGAGAATGTCATCTTCAGTGACAACACCATGCTGTGCCCGAAGGCCTTGCTCAATGG  >  W3110S.gb/1557875‑1557939

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑