Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1559276	1559354	79	100 [0]	[0] 75	ddpF	D‑Ala‑D‑Ala transporter subunit

ATCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTG  >  W3110S.gb/1559211‑1559275                                                                 | aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTTGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1201239/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:548016/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:572485/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:545381/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:529926/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:49152/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:490515/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:48795/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:486755/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:446439/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:412118/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:376512/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:344177/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:337983/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:330944/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:326098/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:32238/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:295607/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:238753/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:236674/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:223281/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:219739/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:212583/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:204597/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:191292/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:910365/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:998173/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:982263/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:972659/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:970592/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:969152/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:966091/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:956359/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:944956/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:943569/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:917716/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:913444/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:549314/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:900883/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:896002/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:805533/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:792076/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:711002/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:708986/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:696344/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:693123/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:684084/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:573523/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1011528/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1238410/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1878638/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1522997/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1517541/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1476788/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:146470/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1464170/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1422026/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:141833/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:136055/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1288901/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1261489/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1536429/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1195150/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1177315/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1153657/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1144424/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1142156/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1117842/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1067558/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1032287/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1022636/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1011612/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1010775/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1544403/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:187770/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:183934/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1818481/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1814052/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1797316/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1792217/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1774964/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1771164/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1750024/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1746179/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1724598/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1695006/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1657381/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1653107/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1632882/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1580972/65‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1538845/65‑1 (MQ=255)  tCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1503139/64‑1 (MQ=255)  tCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:578032/64‑1 (MQ=255)  tCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1517533/64‑1 (MQ=255)  tCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:182024/64‑1 (MQ=255)  tCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:494516/64‑1 (MQ=255)  tCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1872666/64‑1 (MQ=255)  tCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:199873/64‑1 (MQ=255)                  gaTATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:1596693/48‑1 (MQ=255)                        cAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTg  <  1:281473/42‑1 (MQ=255)                                                                 | ATCTGCGCCTGAACGGAGATATCCAGCGCAGAGGTTGGCTCATCAAGCACAATCACGTCAGGCTG  >  W3110S.gb/1559211‑1559275

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑