Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1562968 1562971 4 140 [0] [0] 16 ddpA D‑Ala‑D‑Ala transporter subunit

Only 100 of 140 total aligned reads displayed.

TCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCAA  >  W3110S.gb/1562904‑1562967
                                                               |
tCTGACTCAAACCAGTAATTCTTAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1086439/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGTTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:828625/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:540264/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:561140/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:520260/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:421462/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:402863/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:402082/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:357590/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:332020/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:298066/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:276731/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:260344/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:24017/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1885083/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1874999/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1871346/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1849103/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1822698/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1782132/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1747123/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1734633/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1010475/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1699479/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:169711/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:825388/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:989539/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:958249/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:954129/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:911965/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:90424/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:903299/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:898852/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:863584/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:863186/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:861768/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:544013/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:823546/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:753723/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:733781/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:716093/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:669324/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:597070/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:595799/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:581289/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:573635/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1733502/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1168785/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1332969/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1268908/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1263836/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1259934/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1219760/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1214208/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1211736/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1210320/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1202057/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1187631/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:117436/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1688873/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1162083/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1155118/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1129566/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1122850/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1083687/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1079393/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1061970/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1056079/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1040451/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1018150/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1343687/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1692173/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1670786/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1667029/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1660091/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1604819/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1566420/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1529433/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1506642/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1493459/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:148934/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1466168/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1403465/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1355928/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1357972/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1397716/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1423747/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTACCaa  <  1:1302023/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCCGACTCCAGTTGCCaa  <  1:706555/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGGCGGCAAATTCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:791084/64‑1 (MQ=255)
tCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGGCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1656262/64‑1 (MQ=255)
tCTGAATCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1318964/64‑1 (MQ=255)
 cTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:671154/63‑1 (MQ=255)
 cTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:334863/63‑1 (MQ=255)
 cTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1527464/63‑1 (MQ=255)
 cTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1477894/63‑1 (MQ=255)
 cTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:965397/63‑1 (MQ=255)
 cTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:1343460/63‑1 (MQ=255)
         aaCCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:417314/55‑1 (MQ=255)
                aaTTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCaa  <  1:982871/48‑1 (MQ=255)
                                                               |
TCTGACTCAAACCAGTAATTCATAAACATATACGGGTCGGCAAAATCCGGACTCCAGTTGCCAA  >  W3110S.gb/1562904‑1562967

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: