Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1563573	1563611	39	71 [1]	[0] 43	ddpA	D‑Ala‑D‑Ala transporter subunit

TTACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAATT  >  W3110S.gb/1563508‑1563573                                                                 |  ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCTGAACTAAt   >  1:1127293/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:261961/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:538713/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:516490/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:453155/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:450624/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:417282/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:406039/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:377616/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:324504/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:293526/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:539231/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:245167/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:227388/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1871095/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1831014/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1828288/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1816801/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1805210/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:775756/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:979906/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:968649/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:948409/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:868391/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:868320/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:835361/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:829325/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:788868/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1783789/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:760915/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:753538/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:711530/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:689488/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:683168/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:649675/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:610056/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1193995/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1796709/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:138118/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:132866/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1326134/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1312688/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1265261/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1245341/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1235113/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1452600/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1182194/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1146076/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1104903/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1093111/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1089190/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1071699/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1049148/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1580696/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:102134/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1733400/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1717269/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1677429/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1660456/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1656379/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1590722/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1462119/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:156136/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1519949/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1510024/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1493601/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1483623/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1480789/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:1464743/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCGTTCGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAt   >  1:142421/1‑65 (MQ=255) ttACCGATACCCG‑TTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAAtt  >  1:1056667/1‑65 (MQ=255)                                                                 |  TTACCGATACCCGTTTGAAGTTCGGTTTATTGCCTGGGTAATGCGGATTTGGCACCAGAACTAATT  >  W3110S.gb/1563508‑1563573

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑