Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1569126	1569612	487	75 [0]	[0] 18	[yddW]	[yddW]

GTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTG  >  W3110S.gb/1569062‑1569125                                                                | gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTCATTTg  <  1:1714982/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:315907/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:714497/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:554478/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:548755/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:484737/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:438894/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:432261/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:384597/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:359638/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:343906/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:724737/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:300434/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:294418/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1873968/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1804803/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1799746/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:173994/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1736100/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:849000/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:954342/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:988317/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:914715/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:89639/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:892516/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:890690/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:879808/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:863838/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1730389/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:845599/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:830175/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:818513/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:775690/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:770406/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:751601/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:732730/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:732706/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1130372/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1344528/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1311560/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:13066/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1295676/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1261260/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1235373/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1233484/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1175237/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1358219/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1108145/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1101719/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1085887/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1072173/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1039208/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1018725/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1011695/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1597816/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1699318/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1671327/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1648854/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1645345/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1631275/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1625289/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1611519/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1395794/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1583236/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1542/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1540045/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1536790/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1484049/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1414566/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:140401/64‑1 (MQ=255) gTTTTTCATATTCACACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1808667/64‑1 (MQ=255)  tttttGATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:1053251/63‑1 (MQ=255)  tttttCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:99555/63‑1 (MQ=255)  tttttCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:101303/63‑1 (MQ=255)                aCATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTg  <  1:940713/49‑1 (MQ=255)                                                                | GTTTTTCATATTCATACATTTTTATTAGGGATTTATGGCTGTTTAACTAAGTGTGGTTAATTTG  >  W3110S.gb/1569062‑1569125

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑