Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1592902 1592964 63 120 [0] [0] 18 hipA regulator with hipB

Only 100 of 120 total aligned reads displayed.

GTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAA  >  W3110S.gb/1592837‑1592901
                                                                |
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAGTGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1864879/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:361804/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:574378/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:51399/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:499244/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:498574/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:495486/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:461137/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:404523/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:402513/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:398641/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:396356/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:391419/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:362994/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:605309/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:339844/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:320287/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:309895/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:276013/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:271022/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:263023/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1884190/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1869422/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1868809/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1000718/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:813351/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:9445/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:94050/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:906755/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:906558/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:881325/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:866718/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:851540/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:843846/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:839221/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:836501/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:813476/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1829051/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:786010/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:780770/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:76693/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:753280/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:74219/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:739559/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:738737/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:695018/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:667332/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:65490/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:62030/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1197077/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1429719/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1396837/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1396713/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:136619/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1353991/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1349131/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1313552/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1260579/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1255189/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1250997/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1245970/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1215825/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1432332/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1185642/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1183504/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1157689/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1144781/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1144625/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1143951/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1135385/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1049925/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1044459/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1011868/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1011604/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1592528/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1796128/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1791632/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1788674/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1788401/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1754928/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1742037/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1714894/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1703549/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1684879/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1613217/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1606322/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:180717/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1590892/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:158004/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1566807/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1524969/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1522721/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1503888/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1501449/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1480380/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1471284/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:1450433/1‑65 (MQ=255)
gTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGCAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:425352/1‑65 (MQ=255)
gTTTAAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:116772/1‑65 (MQ=255)
atttGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTaa  >  1:37885/2‑65 (MQ=255)
                                                                |
GTTTGAGATCGCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAA  >  W3110S.gb/1592837‑1592901

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: