Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1593808	1593895	88	37 [0]	[0] 2	[hipA]–[hipB]	[hipA],[hipB]

CAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCA  >  W3110S.gb/1593756‑1593807                                                    | cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:525392/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1813908/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1884415/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:21617/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:332264/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:364990/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:390746/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:468287/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:475927/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:477219/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1773473/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:534974/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:702464/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:738237/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:782283/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:786877/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:805032/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:882949/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:912980/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1460187/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1165729/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1188640/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1252625/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1344871/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1364379/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:137080/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1377777/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1382657/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1018034/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1472637/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1480886/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1496801/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1553334/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1591007/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1671841/1‑52 (MQ=255) cAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1772566/1‑52 (MQ=255) cAGAGAAACTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCa  >  1:1671903/1‑52 (MQ=39)                                                    | CAGCGAAAGTGACAACGGTCTGGCATAACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCA  >  W3110S.gb/1593756‑1593807

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑