Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1607112	1607255	144	40 [0]	[0] 107	lsrB	AI2 transporter

CTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGA  >  W3110S.gb/1607048‑1607111                                                                | cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:638085/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:365919/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:422511/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:439359/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:540071/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:543700/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:555715/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:564131/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:584053/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:607852/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:335548/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:64805/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:654405/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:753193/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:800933/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:814584/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:842990/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:889997/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:994258/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1738816/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1162584/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1207205/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:121278/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1321020/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1489717/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1513986/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1595346/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1642812/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1723339/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:173123/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:190330/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1746102/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1775835/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1789148/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1803825/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1854445/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1858370/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1863597/64‑1 (MQ=255) cTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGGGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:1160204/64‑1 (MQ=255)                         aaCGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGa  <  1:378672/40‑1 (MQ=255)                                                                | CTGATGGCTTGTGTCCGGCACTGAAACGCGCCATGCAACGTGGTGTGAGAGTGCTGACCTGGGA  >  W3110S.gb/1607048‑1607111

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑