Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1646939	1647093	155	12 [0]	[0] 85	[hokD]–[relE]	[hokD],[relE]

TCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACG  >  W3110S.gb/1646874‑1646938                                                                 | tCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACg  <  1:1162389/65‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACg  <  1:1245899/65‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACg  <  1:1687007/65‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACg  <  1:186036/65‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACg  <  1:249889/65‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACg  <  1:279204/65‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACg  <  1:410182/65‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACg  <  1:419331/65‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACg  <  1:651488/65‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACg  <  1:844976/65‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACg  <  1:954258/65‑1 (MQ=255)   tGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACg  <  1:263608/63‑1 (MQ=255)                                                                 | TCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAGAGGTCTTTCCTCGTTACCAGTGCCGTCACTATGACG  >  W3110S.gb/1646874‑1646938

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑