Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1666731	1667003	273	31 [0]	[0] 101	[dmsD]	[dmsD]

ATTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAG  >  W3110S.gb/1666666‑1666730                                                                 | aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:315977/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:998269/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:981660/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:937872/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:882075/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:857473/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:759043/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:706421/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:702504/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:608057/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:576951/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:521204/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:330113/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:1063124/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:31505/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:1886151/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:1267625/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:1268974/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:1869762/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:1821085/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:1717093/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:1512574/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:1701/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:1608508/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:1567419/65‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:1540054/65‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:27479/64‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:448041/64‑1 (MQ=255)    gCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTTGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:663027/62‑1 (MQ=255)                ccTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:1387562/50‑1 (MQ=255)                   ttttCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAg  <  1:361502/47‑1 (MQ=255)                                                                 | ATTGCTGGCATGGCACCTTTTTCCGTGGTCAACACGTTTTCTTGATGTTTTTATCGAAAAAGCAG  >  W3110S.gb/1666666‑1666730

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑