Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1684162	1684263	102	25 [0]	[0] 39	rstA	DNA‑bindng response regulator in two‑component regulatory system with RstB

TCGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCG  >  W3110S.gb/1684114‑1684161                                                | tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:248343/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:910982/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:876288/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:758439/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:73762/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:604593/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:518732/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:512576/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:420550/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:362003/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:335856/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:270228/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:1104631/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:1865209/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:1839700/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:1751849/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:171860/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:1695719/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:1687591/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:1557981/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:1553151/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:1422668/48‑1 (MQ=255) tcGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:1327635/48‑1 (MQ=255)  cGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:1746406/47‑1 (MQ=255)          atatGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCg  <  1:511661/39‑1 (MQ=255)                                                | TCGATAGCGATATGAACCACATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCG  >  W3110S.gb/1684114‑1684161

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑