Missing coverage evidence...
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CAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATC  >  W3110S.gb/1744911‑1744975                                                                 | ctaTCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:441424/63‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:499971/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1027174/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:323974/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:3916/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:393313/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:42305/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:426438/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:468971/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:267840/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:514185/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:612395/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:616372/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:635499/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:738926/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:860954/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:877204/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1870784/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1031262/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1130738/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1209627/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1227461/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1235197/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1285449/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1316804/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1350871/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1600949/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1740268/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1745308/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1847754/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1858524/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:241411/65‑1 (MQ=255) cAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACACACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:654926/65‑1 (MQ=255)  aaTCGACACCAGTTTTGCTGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:867929/64‑1 (MQ=255)  aaTCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1319165/64‑1 (MQ=255)             gTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAAGATACTTACAACTCCTGAAATc  <  1:1702586/53‑1 (MQ=255)                                                                 | CAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATC  >  W3110S.gb/1744911‑1744975

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑