Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1799713	1799899	187	43 [0]	[0] 18	pheS	phenylalanine tRNA synthetase, alpha subunit

TGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCGAAG  >  W3110S.gb/1799649‑1799712                                                                | tGAATTTCATAATCTTTTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:27823/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTACACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1104016/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:492831/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1840930/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1869595/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:277066/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:324557/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:33223/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:33479/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:359146/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:419397/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1787301/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:563155/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:61051/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:664108/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:66613/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:706128/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:712700/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:727440/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:843810/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:9181/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1307377/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:110832/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1200886/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1218291/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1235972/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1241643/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1261859/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1269100/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1289310/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1663457/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1365821/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1379269/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1388067/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1441859/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:145393/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1542330/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1543917/64‑1 (MQ=255) tGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1654747/64‑1 (MQ=255)  gAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1298861/63‑1 (MQ=255)  gAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:1213362/63‑1 (MQ=255)     tttCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACTCAGATCGTTTTCgtag  <  1:221846/60‑1 (MQ=255)                           aTTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCgaag  <  1:390206/38‑1 (MQ=255)                                                                | TGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGCAGATCGTTTTCGAAG  >  W3110S.gb/1799649‑1799712

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑