Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1820428 1820608 181 135 [0] [0] 183 chbR DNA‑binding transcriptional dual regulator

Only 100 of 135 total aligned reads displayed.

TAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAC  >  W3110S.gb/1820363‑1820427
                                                                |
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAACCAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:112538/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGTCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:491982/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:281581/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:471246/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:470163/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:411961/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:387830/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:384142/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:369050/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:361341/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:352152/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:339085/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:33596/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:31320/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:507963/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1861171/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1813023/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1799009/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1753584/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1740660/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1719148/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1701993/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1700132/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1691442/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1691021/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:752208/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:983558/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:949498/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:943756/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:941006/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:898620/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:882631/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:872266/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:851655/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:805721/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:774956/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1007860/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:714339/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:676648/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:643952/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:643731/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:624640/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:595450/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:576559/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:537831/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:532206/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:529094/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:121700/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1447605/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1433460/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1425801/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1415361/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1412405/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1378744/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1343783/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1323891/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1257473/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1251175/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:162300/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1193514/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1177247/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1160187/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1107257/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1106159/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1099314/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1099187/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1033488/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1009482/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1005947/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:147796/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1587534/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1554765/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:155243/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1591395/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1549617/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1592255/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1615280/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1534079/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1524086/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1520739/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1677083/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1449071/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1515390/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1505034/65‑1 (MQ=255)
tAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1501185/65‑1 (MQ=255)
 aaaGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1616169/64‑1 (MQ=255)
 aaaGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1076279/64‑1 (MQ=255)
 aaaGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:841830/64‑1 (MQ=255)
 aaaGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:986319/64‑1 (MQ=255)
 aaaGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1764420/64‑1 (MQ=255)
 aaaGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:246806/64‑1 (MQ=255)
 aaaGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1273946/64‑1 (MQ=255)
 aaaGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:513698/64‑1 (MQ=255)
  aaGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:680376/63‑1 (MQ=255)
  aaGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:236007/63‑1 (MQ=255)
  aaGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1045674/63‑1 (MQ=255)
        gTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1379141/57‑1 (MQ=255)
             tttCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCTGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1543680/52‑1 (MQ=255)
             tttCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:769609/52‑1 (MQ=255)
                        ttttAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAc  <  1:1026040/41‑1 (MQ=255)
                                                                |
TAAAGGACGTTAATTTCTTAAACGTTTTAATAAACAAACTCGGGCTACTATAACCGGCCTCAAAC  >  W3110S.gb/1820363‑1820427

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑