Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1827410	1827543	134	56 [0]	[0] 79	spy/astE	envelope stress induced periplasmic protein/succinylglutamate desuccinylase

ATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAC  >  W3110S.gb/1827345‑1827409                                                                 | atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGCCGAGATTAAc  >  1:1848124/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:588751/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1872253/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:260042/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:279989/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:289640/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:349228/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:371393/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:380101/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:395312/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:471772/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:560477/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:579709/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:580279/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1850238/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:675529/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:694275/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:712445/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:733885/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:776433/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:845913/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:873173/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:881205/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:909672/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:913600/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:925439/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:937453/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:973467/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1344866/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1036633/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1090310/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1111110/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1120599/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1142549/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1156803/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1204784/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1222932/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:124078/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1263968/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1270188/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1292212/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1295712/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1021054/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1358494/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1514758/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1562674/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1660241/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1666109/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1674522/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:176732/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1780235/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1798276/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:180082/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1829102/1‑65 (MQ=255) atatCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:1846918/1‑65 (MQ=255) atatACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAc  >  1:251061/1‑65 (MQ=255)                                                                 | ATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAAC  >  W3110S.gb/1827345‑1827409

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑